最近一个阶段，接二连三的食品安全事故使得不具备专业知识的广大消费者无所适从，只能对食品的选购格外小心。而食品生产厂家对面粉等原料的采购，尤其是一些生产出口面制品的企业，对面粉原料都提出了微生物数量的控制指标。
　　因为小麦中含有碳水化合物、蛋白质、无机盐等丰富的营养，所以为微生物繁殖代谢提供了良好的营养条件。另外由于小麦在收获后的晾晒过程中被人踩踏，有些在柏油路面晾晒过程中的沥青等化学物质的污染，有的在仓储过程和物流运输过程的污染，这些微生物和化学污染物基本粘浮在小麦表皮，小麦表皮的微生物数量，根据受污染程度不同，从每克几千个到几千万个不等。有些微生物对人体健康影响不大，有些是致病菌，当达到一定数量时对人体健康带来一定影响。
　　目前对小麦污染影响比较大的微生物有细菌、霉菌、放线菌、酵母菌、植物病原真菌、芽孢菌、耐热菌等。这些微生物大多数经过高温能杀灭，不会有影响。但是少数如芽孢菌、耐热菌即使经过短时间高温烘焙、蒸煮也无法完全杀灭，最终造成食品含菌。对成品食品会造成保存期短、变质，而真菌对人体健康的影响是真菌毒素，芽孢菌和真菌毒素都属于致病菌，会对消费者的健康和食品安全带来隐患。
　　在小麦制粉过程中，可以完全去除带菌的小麦表皮，但是传统制粉工艺是将小麦破碎后，破碎的小麦表皮和胚乳被反复、多次研磨分离，最终完全去除小麦皮。由于小麦皮和面粉多次接触，使小麦表层的细菌在制粉过程中污染了本身洁净的面粉。虽然现在有一定规模的面粉生产企业都有比较先进的清理工艺和相应的设备，但这些清理设备可以去除小麦表皮所粘浮的灰尘和混在小麦中的各类杂质，却无法清理粘浮在小麦表皮的各种细菌，为此一种新的制粉工艺，剥皮制粉解决了以上问题。在欧洲各面粉厂家，为了生产出符合欧盟卫生标准的面粉，都配有小麦剥皮机。小麦剥皮制粉工艺是先将小麦中的杂质清理干净，再剥去小麦最外面的一层表皮，剥皮后的洁净小麦进入磨粉机磨粉，从而极大的减少了细菌污染的机会。这就好比原来的制粉工艺是把一堆苹果切碎后再削皮，剥皮制粉工艺是先把苹果皮削干净后再切碎，杜绝了果皮对果肉的污染。用这种新工艺生产的面粉更加洁净、安全。剥皮机工艺的采用就相当于在我们平常使用的电脑中加了一道防火墙的杀毒软件，而剥皮机则是为面粉加工过程中增加了一道硬件设备的防火墙，一切有可能被污染的带菌小麦都因剥去了带菌的表皮，降低了细菌含量，保证了食品安全。虽然目前国家除了黄曲霉毒素，还没有针对面粉微生物制定国家卫生标准，由于国家对面粉企业生产的面粉中微生物没有具体要求和标准，再加上设备需要进口，价格比较高，每年还会增加100多万的运行成本，所以推广有一定难度。