水科院组织和参加事故专题研讨会十余次，完成了《“塔斯曼海”溢油事故应急处理及索赔案》、《美国墨西哥湾“深水地平线”石油钻井平台爆炸泄漏事故及索赔概况》等国内外溢油索赔案例分析，撰写了《渤海溢油事件石油烃类物质对水产品质量安全影响的初步报告》等专题报告。根据调查结果以及溢油事发海域天然渔业资源调查历史数据，撰写了《蓬莱19-3油田溢油事故对渤海天然渔业资源损害评估报告》和《蓬莱19-3油田溢油对河北辽宁部分区县养殖生物损害评估报告》，为渔业主管部门开展溢油事故造成天然渔业资源和水产养殖业损失索赔工作提供了重要科学数据和技术支撑。相关工作得到农业部张桃林副部长和牛盾副部长的肯定。
　　五、成功选育10余个新品种，为产业发展添活力
　　种质是发展现代渔业的核心和基础。“十一五”期间，水科院共培育出“夏奥1号”奥利亚罗非鱼、杂交青虾“太湖1号”、中国对虾“黄海2号”、松浦镜鲤、长丰鲢、福瑞鲤、大口黑鲈“优鲈1号”、斑节对虾“南海1号”、“丹法鲆”和牙鲆“鲆优1号”等10个水产新品种。2011年，又有松浦红镜鲤和全雌牙鲆2个品种通过水产原种和良种审定委员会审定。这一批水产新品种的培育成功和规模化养殖示范，为优化我国水产养殖结构，促进渔民增产增收，推进我国水产良种产业化及可持续发展发挥了重要作用，切实推动了我国渔业产业的转型升级。
　　其中，杂交青虾“太湖1号”作为国内外首个人工培育的淡水虾蟹新品种，具有个体大、产量高、抗病力强等特点在江苏、安徽、浙江、上海等青虾主养区进行了大规模的示范推广，累计繁育虾苗2473.97亿尾，示范推广面积699.61万亩，实现总利润87.81亿元，促进了青虾产业的健康发展，呈现出显著的经济和社会效益。相关成果获2011年度中华农业科技一等奖。通过传统选育技术和现代分子标记技术培育出的大口黑鲈“优鲈1号”新品种生长快、高背短尾畸形率低，具有明显的养殖优势，近两年，在广东、江苏、浙江、湖南和四川等省份进行池塘养殖技术示范及推广养殖，累计推广养殖面积9.23万亩，新增产值9.09亿元，新增利润3.96亿元，有效促进了产业的健康发展。