异育银鲫发病，除由生物病原和非生物因素引起外，还和机体自身的免疫能力和对疾病、环境的抵抗力有关。因此，养殖户只需抓住鱼病防治和及时治疗，能使异育银鲫养殖达到最佳效果。异育银鲫在春季主要有以下四种鱼病：水霉病、烂鳃病、竖鳞病和气泡病。
　　水霉病
　　1.流行及病因：以早春、晚冬最为流行，经由水而传播各处，常常会带来严重的经济损失。（1）鱼体受伤或越冬鱼池放养密度过高等；（2）池塘水环境不好，易出现浮头，鱼体冻伤，就易感染水霉病；（3）一些底质较差，位置处于风口的鱼塘发病相对重些。
　　2.症状：病变部位初期呈圆形，后期则呈不规则的斑块，严重时皮肤破损肌肉裸露。病鱼食欲减退、行动呆滞，在病鱼头部、吻端、尾部、躯干或鳍条，有时甚至在鳃部都有水霉菌寄生，并粘附污泥和藻类，其状如覆盖棉絮，故俗称“白毛病”。根据鱼的活动和摄食情况，肉眼观察鱼体或鱼卵上的白毛症状，即可做出诊断。必要时用显微镜检查菌丝体。
　　3.防治方法：此病以预防为主，难治疗。（1）除去池底过多淤泥，并用200毫克/升生石灰或20毫克/升漂白粉消毒；（2）加强饲养管理，提高鱼体抵抗力，平时注意消毒，在捕捞、运输等操作过程中尽量避免鱼体受伤，注意合理放养密度，尽量避免在水温15℃以下的条件下处理养殖银鲫，以免鱼体冻伤或擦伤；（3）发病鱼池用0.04%食盐和0.04%小苏打合剂（1：1）全池泼洒，使池水药物浓度为400克/立方米，具有一定治疗效果；（4）病鱼用20毫克/升的聚维酮碘溶液制剂浸泡15分钟~20分钟；（5）发现鱼已感染水霉病每亩水面水深1米，用菖蒲叶2.5公斤~5公斤、食盐0.5公斤~1公斤，加入人尿2公斤~5公斤混合均匀加水稀释全池泼洒。
　　烂鳃病
　　1.流行及病因：此病是异育银鲫较严重病害之一，流行广，损害大，全年发生，4月~10月为流行季节。引发烂鳃病的病因主要有三种：一是细菌-鱼害粘球菌引起细菌性烂鳃病；二是真菌-鳃霉引起的鳃霉病；三是寄生虫引起的各种鳃病，包括原生动物、指环虫、粘孢子虫和中华鳋引起的各种鳃病。
　　2.症状：由鱼害粘球菌引起的细菌性烂鳃病，鳃丝腐烂，严重时鳃软骨外露，并且常带有污泥，鳃盖内侧表面充血，中央表皮常被腐蚀成一个圆形透明的小洞，俗称“开天窗”。