鱼苗运输是水产养殖经营活动中的一个重要环节，由于鱼苗相对于成鱼来说，个体小，体质弱，抗病差，容易在运输过程中伤亡。造成鱼苗运输中伤亡的主要原因包括鱼苗缺氧、鱼体损伤以及途中的颠簸、水温的变化等因素影响。在实践中，要想提高鱼苗运输中的成活率，必须把握“认真准备、把握时机、控制密度、讲求技巧”这四个要点。
　　认真准备 一是要制定详尽的运鱼计划。鱼苗运输前，事先要制定详尽的运输计划，包括运输容器、交通工具、人员组织以及中途换水等事项，若是托运，还需算好运抵时间，以便通知接货人准时接货。二是要选择适宜的运鱼用水。运输鱼苗的用水，只要是无污染、水质清新的河水、池水或水库水均可，要求水温必须与鱼苗养殖池水温基本一致，如采用自来水，可适当除氯后再使用。运输中的水温与原水体中的水温温差不可超过1℃。三是鱼苗要适时停食并拉网锻炼，使鱼苗体内的粪便排除干净，降低鱼苗的代谢率，以免排入运输容器中污染水质。四是要选好合适的运输方法。短距离运输适用于运输时间在2小时以内鱼苗运输，可以用塑料桶、塑料袋等器物运输。而长距离运输一般运输时间在10小时左右或更长时间，可使用塑料袋充氧运输或活鱼运输车运输。前者运量少，简单方便；后者运量多，成活率高，比较常用。
　　把握时机 鱼苗在温度低时吃食少，耗氧低，且温度越低，水中溶氧越多。因此，在温度低时运输鱼苗成活率高。同时，水温愈低，鱼苗活动愈弱，在捕捞、装运时受伤几率小。实践证明水温在15℃~20℃时运输鱼苗最好。如必须在冬季运鱼苗，一定要注意保暖，水温过低，会使鱼苗冻伤。若在夏季运输，可在塑料袋外加冰块降温，效果颇佳。最好避开高温季节晴天光照强烈的中午、阴雨天气和凌晨等易出现严重缺氧浮头的时间段运输鱼苗。
　　控制密度鱼苗运输的密度应与当时当地的气候情况、水温、运输时间及鱼苗的品种、规格等因素结合起来考虑。利用塑料袋充氧运输时，塑料鱼苗袋规格可以为70厘米×40厘米，水温在20℃~25℃，每袋可装运鱼苗8万尾~10万尾，夏花1200尾~1500尾；或装运5厘米~7厘米长的鱼种600尾~800尾，7厘米~8厘米的鱼种300尾~500尾，可保证在24小时内成活率达90%左右。运输时数量千万不可贪多，占“小便宜”，只管要求售货方给多给足数量，而不顾运输工具的承受能力，结果得不偿失。