蔓枯病、灰霉病、菌核病、炭疽病和细菌性软腐病均会造成黄瓜茎蔓腐烂，应辨明病因对症治疗。
　　蔓枯病 近期黄瓜烂蔓大多由蔓枯病引起。蔓枯病在黄瓜茎蔓上的症状表现为，发病初期出现椭圆形或菱形白色病斑，有时会流出乳白色胶状物，严重时茎蔓开裂，最后导致茎蔓腐烂。叶片也易染病，病菌开始从叶片边缘侵入，向内发展，呈“V”字形，病斑淡黄色，有不清晰的轮纹，上面有很多小黑点。
　　黄瓜蔓枯病在温度18～25℃、相对湿度85%以上时发生较重。冬季大棚管理应注意升温排湿，白天温度控制在25～33℃，夜间控制在15～20℃。在保证棚温的前提下加大通风。棚内湿度过大与浇水量有很大关系，宜采用膜下浇小水的方法浇水，以浇透为度，田面不能积水。发病田块应及早摘除病枝和病叶，并带出棚外深埋或焚烧。
　　黄瓜进入开花结果期后，因果实膨大吸收了大量的营养物质，造成茎蔓细弱、叶片变薄，植株抗逆能力降低，易被病菌侵染。可以用80%福美双可湿性粉剂或75%百菌清可湿性粉剂500倍液喷雾预防，每隔7～10天一次，发病后用25%咪鲜胺乳油1000倍液喷雾。
　　灰霉病 灰霉病是冬季大棚黄瓜上高发的一种病害，大多从残花开始侵入，引起瓜腐烂。这些染病的残花和烂瓜附着在茎蔓上，还会引起茎蔓腐烂，严重时造成茎蔓折断，植株枯死。病菌能产生大量孢子，随气流传播，病情较难控制。灰霉病在温度20～23℃、相对湿度90%以上时易发生。发病前可以用40%多菌灵可湿性粉剂或75%甲基硫菌灵可湿性粉剂500倍液喷雾预防，每隔7～10天一次。发生灰霉病后应控制放风量，保持38～40℃高温闷棚2小时，以杀灭棚内大量病菌。同时，用50%腐霉利可湿性粉剂或50%乙烯菌核利水分散粒剂（500倍液）混加40%多菌灵可湿性粉剂（500倍液）喷雾。结合应用50%腐霉利烟剂等熏棚，杀灭棚内病菌。
　　菌核病 茎蔓染病多在近地面的茎部开始发病，初期出现淡褐色水渍状病斑，后期病茎软腐，长出白色棉絮状菌丝。病部的髓腔腐烂中空或开裂，后期菌丝密集形成黑色鼠粪状菌核。菌核病发病的适宜温度为24℃，相对湿度为85%以上，棚内湿度降至80%以下时不发病。防治菌核病应注意环境调节，降低棚内湿度。药剂防治，可以用50%乙烯菌核利水分散粒剂或50%腐霉利可湿性粉剂500倍液喷雾，或者用50%腐霉利烟剂熏棚。